Добавить в избранное
Форум
Правила сайта "Мир Книг"
Группа в Вконтакте
Подписка на книги
Правообладателям
Найти книгу:
Навигация
Вход на сайт
Регистрация



Реклама



Название: Genomics in the Cloud: Using Docker, GATK, and WDL in Terra
Автор: Geraldine A. Van der Auwera, Brian D. O'Connor
Издательство: O'Reilly Media
Год: 2020-04-02
Формат: epub
Страниц: 506
Размер: 27.4 Mb
Язык: English

Data in the genomics field is booming. In just a few years, organizations such as the National Institutes of Health (NIH) will host 50+ petabytes—or over 50 million gigabytes—of genomic data, and they’re turning to cloud infrastructure to make that data available to the research community. How do you adapt analysis tools and protocols to access and analyze that volume of data in the cloud?
With this practical book, researchers will learn how to work with genomics algorithms using open source tools including the Genome Analysis Toolkit (GATK), Docker, WDL, and Terra. Geraldine Van der Auwera, longtime custodian of the GATK user community, and Brian O’Connor of the UC Santa Cruz Genomics Institute, guide you through the process. You’ll learn by working with real data and genomics algorithms from the field.
This book covers:
Essential genomics and computing technology background
Basic cloud computing operations
Getting started with GATK, plus three major GATK Best Practices pipelines
Automating analysis with scripted workflows using WDL and Cromwell
Scaling up workflow execution in the cloud, including parallelization and cost optimization
Interactive analysis in the cloud using Jupyter notebooks
Secure collaboration and computational reproducibility using Terra








НЕ РАБОТАЕТ TURBOBIT.NET? ЕСТЬ РЕШЕНИЕ, ЖМИ СЮДА!





Автор: bomboane 4-04-2020, 10:27 | Напечатать | СООБЩИТЬ ОБ ОШИБКЕ ИЛИ НЕ РАБОЧЕЙ ССЫЛКЕ
 
Уважаемый посетитель, Вы зашли на сайт как незарегистрированный пользователь.





С этой публикацией часто скачивают:
    {related-news}

Посетители, находящиеся в группе Гости, не могут оставлять комментарии к данной публикации.





 MyMirKnig.ru  ©2019     При использовании материалов библиотеки обязательна обратная активная ссылка    Политика конфиденциальности